Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC90BQ9GZT6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC90BQ9GZT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC90BQ9GZT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC90BQ9GZT6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC90BQ9GZT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms