Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2J2Q9GZM3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2J2Q9GZM3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms