Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SRCIN1Q9C0H9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SRCIN1Q9C0H9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SRCIN1Q9C0H9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SRCIN1Q9C0H9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SRCIN1Q9C0H9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.6 ms