Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CFAP74Q9C0B2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CFAP74Q9C0B2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CFAP74Q9C0B2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CFAP74Q9C0B2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
CFAP74Q9C0B2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFAP74Q9C0B2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CFAP74Q9C0B2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CFAP74Q9C0B2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CFAP74Q9C0B2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CFAP74Q9C0B2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CFAP74Q9C0B2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CFAP74Q9C0B2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CFAP74Q9C0B2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CFAP74Q9C0B2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CFAP74Q9C0B2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CFAP74Q9C0B2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFAP74Q9C0B2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFAP74Q9C0B2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CFAP74Q9C0B2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
CFAP74Q9C0B2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CFAP74Q9C0B2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CFAP74Q9C0B2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CFAP74Q9C0B2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
CFAP74Q9C0B2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CFAP74Q9C0B2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CFAP74Q9C0B2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
CFAP74Q9C0B2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CFAP74Q9C0B2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CFAP74Q9C0B2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CFAP74Q9C0B2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
CFAP74Q9C0B2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CFAP74Q9C0B2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CFAP74Q9C0B2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CFAP74Q9C0B2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CFAP74Q9C0B2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CFAP74Q9C0B2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CFAP74Q9C0B2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CFAP74Q9C0B2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CFAP74Q9C0B2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms