Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXQ1Q9C009 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXQ1Q9C009 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXQ1Q9C009 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXQ1Q9C009 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXQ1Q9C009 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
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