Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM6SF2Q9BZW4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM6SF2Q9BZW4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM6SF2Q9BZW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM6SF2Q9BZW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TM6SF2Q9BZW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TM6SF2Q9BZW4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TM6SF2Q9BZW4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM6SF2Q9BZW4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM6SF2Q9BZW4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms