Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
UBXN6Q9BZV1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBXN6Q9BZV1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN6Q9BZV1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBXN6Q9BZV1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN6Q9BZV1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN6Q9BZV1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN6Q9BZV1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms