Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXP3Q9BZS1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXP3Q9BZS1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXP3Q9BZS1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXP3Q9BZS1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXP3Q9BZS1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms