Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDEM3Q9BZQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDEM3Q9BZQ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDEM3Q9BZQ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms