Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUF2Q9BZD4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUF2Q9BZD4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUF2Q9BZD4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUF2Q9BZD4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUF2Q9BZD4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms