Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PBX4Q9BYU1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX4Q9BYU1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PBX4Q9BYU1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBX4Q9BYU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBX4Q9BYU1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBX4Q9BYU1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBX4Q9BYU1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBX4Q9BYU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBX4Q9BYU1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBX4Q9BYU1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBX4Q9BYU1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBX4Q9BYU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBX4Q9BYU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PBX4Q9BYU1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX4Q9BYU1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms