Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GSDMCQ9BYG8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSDMCQ9BYG8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMCQ9BYG8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMCQ9BYG8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms