Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE2

TMPRSS13, Transmembrane protease serine 13, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS13Q9BYE2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS13Q9BYE2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS13Q9BYE2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS13Q9BYE2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS13Q9BYE2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms