Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A5Q9BY07 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A5Q9BY07 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A5Q9BY07 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A5Q9BY07 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms