Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNHG12Q9BXW3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNHG12Q9BXW3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNHG12Q9BXW3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNHG12Q9BXW3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms