Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXI9

C1QTNF6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF6Q9BXI9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF6Q9BXI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QTNF6Q9BXI9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QTNF6Q9BXI9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QTNF6Q9BXI9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF6Q9BXI9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF6Q9BXI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF6Q9BXI9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF6Q9BXI9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF6Q9BXI9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF6Q9BXI9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF6Q9BXI9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF6Q9BXI9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms