Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LSM14BQ9BX40 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSM14BQ9BX40 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LSM14BQ9BX40 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LSM14BQ9BX40 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LSM14BQ9BX40 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms