Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT27Q9BW83 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT27Q9BW83 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT27Q9BW83 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT27Q9BW83 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT27Q9BW83 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms