Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THUMPD3Q9BV44 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THUMPD3Q9BV44 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THUMPD3Q9BV44 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD3Q9BV44 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms