Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHD1Q9BUP0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHD1Q9BUP0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EFHD1Q9BUP0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFHD1Q9BUP0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms