Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT4

MED10, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED10Q9BTT4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MED10Q9BTT4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MED10Q9BTT4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED10Q9BTT4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED10Q9BTT4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED10Q9BTT4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
MED10Q9BTT4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MED10Q9BTT4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED10Q9BTT4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED10Q9BTT4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MED10Q9BTT4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms