Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FERMT1Q9BQL6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FERMT1Q9BQL6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FERMT1Q9BQL6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
FERMT1Q9BQL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FERMT1Q9BQL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FERMT1Q9BQL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FERMT1Q9BQL6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms