Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNF2Q99496 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF2Q99496 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF2Q99496 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms