Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2Q96T21 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SECISBP2Q96T21 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SECISBP2Q96T21 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SECISBP2Q96T21 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SECISBP2Q96T21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SECISBP2Q96T21 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SECISBP2Q96T21 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SECISBP2Q96T21 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SECISBP2Q96T21 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SECISBP2Q96T21 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SECISBP2Q96T21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SECISBP2Q96T21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SECISBP2Q96T21 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms