Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEBP4Q96S96 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PEBP4Q96S96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PEBP4Q96S96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEBP4Q96S96 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEBP4Q96S96 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PEBP4Q96S96 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms