Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FERD3LQ96RJ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FERD3LQ96RJ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FERD3LQ96RJ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FERD3LQ96RJ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERD3LQ96RJ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERD3LQ96RJ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms