Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FERD3LQ96RJ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FERD3LQ96RJ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERD3LQ96RJ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FERD3LQ96RJ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FERD3LQ96RJ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FERD3LQ96RJ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FERD3LQ96RJ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FERD3LQ96RJ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERD3LQ96RJ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERD3LQ96RJ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms