Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP3Q96P47 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP3Q96P47 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP3Q96P47 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AGAP3Q96P47 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP3Q96P47 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP3Q96P47 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms