Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXN4Q96NZ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXN4Q96NZ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms