Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ6

ZFP3, Zinc finger protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP3Q96NJ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFP3Q96NJ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP3Q96NJ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFP3Q96NJ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFP3Q96NJ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFP3Q96NJ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms