Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD6Q96NE9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMD6Q96NE9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMD6Q96NE9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FRMD6Q96NE9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms