Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COG8Q96MW5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG8Q96MW5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG8Q96MW5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG8Q96MW5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG8Q96MW5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG8Q96MW5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms