Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC114Q96M63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC114Q96M63 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC114Q96M63 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms