Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TNIP3Q96KP6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNIP3Q96KP6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNIP3Q96KP6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNIP3Q96KP6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms