Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
MS4A4AQ96JQ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MS4A4AQ96JQ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MS4A4AQ96JQ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
MS4A4AQ96JQ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MS4A4AQ96JQ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A4AQ96JQ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
MS4A4AQ96JQ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A4AQ96JQ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms