Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SGSM3Q96HU1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SGSM3Q96HU1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM3Q96HU1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGSM3Q96HU1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGSM3Q96HU1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1016.6 ms