Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPNE2Q96FN4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE2Q96FN4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms