Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTERF3Q96E29 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTERF3Q96E29 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF3Q96E29 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTERF3Q96E29 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms