Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NMD3Q96D46 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NMD3Q96D46 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMD3Q96D46 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NMD3Q96D46 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms