Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EME1Q96AY2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EME1Q96AY2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EME1Q96AY2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EME1Q96AY2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms