Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RERGQ96A58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RERGQ96A58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RERGQ96A58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RERGQ96A58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RERGQ96A58 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms