Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKD1Q969G9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKD1Q969G9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NKD1Q969G9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKD1Q969G9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NKD1Q969G9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.8 ms