Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCEAL3Q969E4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCEAL3Q969E4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCEAL3Q969E4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCEAL3Q969E4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCEAL3Q969E4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms