Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDEM1Q92611 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDEM1Q92611 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDEM1Q92611 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDEM1Q92611 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDEM1Q92611 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDEM1Q92611 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDEM1Q92611 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDEM1Q92611 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDEM1Q92611 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDEM1Q92611 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDEM1Q92611 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDEM1Q92611 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDEM1Q92611 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EDEM1Q92611 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDEM1Q92611 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms