Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATRIPQ8WXE1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATRIPQ8WXE1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATRIPQ8WXE1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATRIPQ8WXE1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATRIPQ8WXE1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms