Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CASKIN1Q8WXD9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
CASKIN1Q8WXD9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
CASKIN1Q8WXD9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CASKIN1Q8WXD9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CASKIN1Q8WXD9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CASKIN1Q8WXD9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CASKIN1Q8WXD9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CASKIN1Q8WXD9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CASKIN1Q8WXD9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CASKIN1Q8WXD9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CASKIN1Q8WXD9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CASKIN1Q8WXD9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CASKIN1Q8WXD9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CASKIN1Q8WXD9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
CASKIN1Q8WXD9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CASKIN1Q8WXD9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
CASKIN1Q8WXD9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CASKIN1Q8WXD9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CASKIN1Q8WXD9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CASKIN1Q8WXD9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CASKIN1Q8WXD9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CASKIN1Q8WXD9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CASKIN1Q8WXD9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CASKIN1Q8WXD9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CASKIN1Q8WXD9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CASKIN1Q8WXD9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CASKIN1Q8WXD9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CASKIN1Q8WXD9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CASKIN1Q8WXD9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CASKIN1Q8WXD9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.76■■■■■ 4.11
CASKIN1Q8WXD9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CASKIN1Q8WXD9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CASKIN1Q8WXD9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CASKIN1Q8WXD9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CASKIN1Q8WXD9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CASKIN1Q8WXD9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms