Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC44.83■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
TRIM41Q8WV44 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC44.8■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC44.79■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
TRIM41Q8WV44 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
TRIM41Q8WV44 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
TRIM41Q8WV44 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
TRIM41Q8WV44 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
TRIM41Q8WV44 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
TRIM41Q8WV44 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
TRIM41Q8WV44 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.72■■■■■ 4.75
TRIM41Q8WV44 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
TRIM41Q8WV44 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
TRIM41Q8WV44 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
TRIM41Q8WV44 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
TRIM41Q8WV44 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
TRIM41Q8WV44 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.63■■■■■ 4.73
TRIM41Q8WV44 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
TRIM41Q8WV44 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
TRIM41Q8WV44 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
TRIM41Q8WV44 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
TRIM41Q8WV44 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
TRIM41Q8WV44 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
TRIM41Q8WV44 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
TRIM41Q8WV44 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.56■■■■■ 4.72
TRIM41Q8WV44 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
TRIM41Q8WV44 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
TRIM41Q8WV44 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
TRIM41Q8WV44 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
TRIM41Q8WV44 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
TRIM41Q8WV44 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
TRIM41Q8WV44 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
TRIM41Q8WV44 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
TRIM41Q8WV44 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
TRIM41Q8WV44 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
TRIM41Q8WV44 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
TRIM41Q8WV44 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
TRIM41Q8WV44 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.42■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC44.39■■■■■ 4.7
TRIM41Q8WV44 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
TRIM41Q8WV44 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms