Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC12Q8WUD4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC12Q8WUD4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC12Q8WUD4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC12Q8WUD4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms