Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF2Q8TEC5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SH3RF2Q8TEC5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3RF2Q8TEC5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3RF2Q8TEC5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3RF2Q8TEC5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3RF2Q8TEC5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3RF2Q8TEC5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3RF2Q8TEC5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3RF2Q8TEC5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3RF2Q8TEC5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SH3RF2Q8TEC5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3RF2Q8TEC5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3RF2Q8TEC5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms