Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNDC8Q8TC99 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNDC8Q8TC99 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FNDC8Q8TC99 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC8Q8TC99 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms