Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MDM1Q8TC05 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MDM1Q8TC05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MDM1Q8TC05 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MDM1Q8TC05 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MDM1Q8TC05 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms